Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul9Q80TT8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms