Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf8Q80TJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms