Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms