Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp6r1Q7TSI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp6r1Q7TSI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms