Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1bQ7TSF1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms