Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms