Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek5Q7TSC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms