Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka6Q7TPS0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms