Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms