Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShprhQ7TPQ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ShprhQ7TPQ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShprhQ7TPQ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms