Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms