Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smap2Q7TN29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smap2Q7TN29 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smap2Q7TN29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smap2Q7TN29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms