Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms