Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr43Q6ZQL4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr43Q6ZQL4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr43Q6ZQL4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr43Q6ZQL4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms