Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms