Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms