Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ift172Q6VH22 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift172Q6VH22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms