Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd1Q6PIP5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms