Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc82Q6PG04 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms