Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms