Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a1Q6PEM8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms