Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gramd2bQ6PEM6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms