Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtifQ6PEE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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