Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd4Q6PDQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd4Q6PDQ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd4Q6PDQ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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