Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms