Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms