Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms