Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2aQ6P4T0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms