Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms