Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep78Q6IRU7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms