Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms