Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms