Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm5416Q6IE28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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