Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms