Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca2Q6DIC0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca2Q6DIC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms