Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms