Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms