Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Mysm1Q69Z66 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mysm1Q69Z66 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Mysm1Q69Z66 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Mysm1Q69Z66 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Mysm1Q69Z66 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Mysm1Q69Z66 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Mysm1Q69Z66 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mysm1Q69Z66 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms