Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms