Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms