Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2bQ64511 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2bQ64511 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms