Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zfp248Q640N4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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