Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc18Q640L5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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