Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms