Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga3Q62470 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms