Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms