Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms