Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Hoxa13Q62424 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Hoxa13Q62424 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Hoxa13Q62424 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa13Q62424 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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