Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox19Q62249 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox19Q62249 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox19Q62249 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox19Q62249 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox19Q62249 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox19Q62249 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms