Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms